أثناء التنظيف بالنفث النبضي، تتعرض أكياس الترشيح المسطحة لتشوه أكبر من الأكياس الدائرية. ونتيجة لذلك، عندما يعود الكيس إلى وضعه الأصلي بعد تفريغه من الهواء، فإنه يصطدم بالقفص بقوة أكبر، مما يؤدي إلى زيادة تسرب الغبار. كما أن هذه الحركة العنيفة تزيد من انتقال الغبار إلى الأكياس المجاورة مقارنةً بالتصميمات الدائرية.
في ظل أحجام غازات الاحتراق وسرعات الترشيح وأقطار الأكياس المتطابقة، يؤدي زيادة طول الكيس إلى تقليل العدد الإجمالي للأكياس المطلوبة. وهذا يقلل من المساحة التي يشغلها النظام ويقلل من عدد الصمامات اللولبية وصمامات النبض وأنابيب النفخ، مما يخفض الاستثمار الأولي ويقصر دورة التنظيف. مع ذلك، في أنظمة التنظيف المتصلة بالإنترنت، تزيد الأكياس الأطول من خطر إعادة ارتباط الغبار المنبعث بالأكياس. أما في أنظمة التنظيف غير المتصلة بالإنترنت، فتتطلب الأكياس الأطول فترات توقف أطول بعد النبض، مما يبطئ معدل استعادة الترشيح في الحجرة المعزولة.
لمنع خيوط السدى واللحمة من التلف أثناء الإنتاج، يُفضل قص قماش أكياس الترشيح باستخدام مكواة لحام كهربائية (بقوة 1500 واط). في صناعة الأدوية، يجب شطف أكياس الترشيح بالماء الدافئ قبل الاستخدام لإزالة الملوثات السطحية. يساعد الغسيل الدوري (بتركيزات كيميائية مُعدّلة حسب الظروف) على تليين القماش، واستعادة خاصية كراهية الماء ونفاذية الهواء، وبالتالي إطالة عمر الكيس.